Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Creb3l3Q91XE9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms