Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd3Q91WC0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms