Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms