Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI36

Pxn, Paxillin, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PxnQ8VI36 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PxnQ8VI36 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PxnQ8VI36 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PxnQ8VI36 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PxnQ8VI36 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PxnQ8VI36 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PxnQ8VI36 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PxnQ8VI36 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PxnQ8VI36 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PxnQ8VI36 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PxnQ8VI36 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PxnQ8VI36 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PxnQ8VI36 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PxnQ8VI36 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PxnQ8VI36 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PxnQ8VI36 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PxnQ8VI36 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PxnQ8VI36 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PxnQ8VI36 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PxnQ8VI36 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PxnQ8VI36 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PxnQ8VI36 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PxnQ8VI36 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PxnQ8VI36 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PxnQ8VI36 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PxnQ8VI36 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PxnQ8VI36 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PxnQ8VI36 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PxnQ8VI36 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PxnQ8VI36 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PxnQ8VI36 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PxnQ8VI36 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PxnQ8VI36 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PxnQ8VI36 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PxnQ8VI36 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PxnQ8VI36 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PxnQ8VI36 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PxnQ8VI36 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PxnQ8VI36 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PxnQ8VI36 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PxnQ8VI36 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PxnQ8VI36 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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