Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE62

Paip1, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paip1Q8VE62 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms