Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc39cQ8VE09 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc39cQ8VE09 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc39cQ8VE09 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc39cQ8VE09 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc39cQ8VE09 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc39cQ8VE09 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc39cQ8VE09 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc39cQ8VE09 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc39cQ8VE09 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc39cQ8VE09 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ttc39cQ8VE09 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ttc39cQ8VE09 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc39cQ8VE09 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms