Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms