Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms