Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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