Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms