Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cops8Q8VBV7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops8Q8VBV7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms