Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4F0

Mcoln3, Mucolipin-3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln3Q8R4F0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms