Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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