Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms