Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms