Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cnot6Q8K3P5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms