Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC21.3■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms