Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3F2

Mmp21, Matrix metalloproteinase-21, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp21Q8K3F2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mmp21Q8K3F2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mmp21Q8K3F2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mmp21Q8K3F2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms