Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms