Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms