Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W3

Txndc11, Thioredoxin domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc11Q8K2W3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc11Q8K2W3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms