Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc12Q8K2L8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms