Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud6bQ8K2H2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms