Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms