Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms