Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms