Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms