Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIP4

Mark4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark4Q8CIP4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mark4Q8CIP4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mark4Q8CIP4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms