Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CopaQ8CIE6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms