Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcerg1Q8CGF7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms