Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ercc8Q8CFD5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ercc8Q8CFD5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ercc8Q8CFD5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ercc8Q8CFD5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ercc8Q8CFD5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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