Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms