Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc9Q8CDN9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms