Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc38Q8CDN8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms