Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms