Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms