Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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