Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7E7

Stbd1, Starch-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stbd1Q8C7E7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stbd1Q8C7E7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stbd1Q8C7E7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Stbd1Q8C7E7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stbd1Q8C7E7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Stbd1Q8C7E7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stbd1Q8C7E7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stbd1Q8C7E7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stbd1Q8C7E7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stbd1Q8C7E7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stbd1Q8C7E7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stbd1Q8C7E7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stbd1Q8C7E7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Stbd1Q8C7E7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stbd1Q8C7E7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stbd1Q8C7E7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stbd1Q8C7E7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stbd1Q8C7E7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stbd1Q8C7E7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stbd1Q8C7E7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stbd1Q8C7E7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stbd1Q8C7E7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Stbd1Q8C7E7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms