Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms