Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ubqln3Q8C5U9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ubqln3Q8C5U9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ubqln3Q8C5U9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubqln3Q8C5U9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubqln3Q8C5U9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubqln3Q8C5U9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Ubqln3Q8C5U9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubqln3Q8C5U9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Ubqln3Q8C5U9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Ubqln3Q8C5U9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Ubqln3Q8C5U9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubqln3Q8C5U9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubqln3Q8C5U9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubqln3Q8C5U9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubqln3Q8C5U9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubqln3Q8C5U9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubqln3Q8C5U9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubqln3Q8C5U9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubqln3Q8C5U9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubqln3Q8C5U9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Ubqln3Q8C5U9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubqln3Q8C5U9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubqln3Q8C5U9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubqln3Q8C5U9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubqln3Q8C5U9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubqln3Q8C5U9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Ubqln3Q8C5U9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
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