Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Amigo3Q8C2S7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Amigo3Q8C2S7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Amigo3Q8C2S7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Amigo3Q8C2S7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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