Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hdac7Q8C2B3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms