Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska3Q8C263 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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