Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYM7

Rsph4a, Radial spoke head protein 4 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph4aQ8BYM7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rsph4aQ8BYM7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph4aQ8BYM7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms