Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms