Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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