Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWQ6

UPF0505 protein C16orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BWQ6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BWQ6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BWQ6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BWQ6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BWQ6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BWQ6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BWQ6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BWQ6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BWQ6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BWQ6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BWQ6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BWQ6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BWQ6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BWQ6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8BWQ6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8BWQ6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8BWQ6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8BWQ6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8BWQ6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BWQ6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms