Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Usp38Q8BW70 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Usp38Q8BW70 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Usp38Q8BW70 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Usp38Q8BW70 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Usp38Q8BW70 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
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Usp38Q8BW70 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Usp38Q8BW70 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Usp38Q8BW70 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Usp38Q8BW70 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Usp38Q8BW70 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Usp38Q8BW70 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Usp38Q8BW70 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms