Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms