Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BPC6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms